按照教育部要求，下一步北部湾大学将立足北部湾，面向南海与东盟，服务国家战略和区域经济社会发展，建设以海洋为主要特色的工、理、管等学科相互渗透、交叉、融合的多学科体系，重点建设海洋科学、水产养殖学、船舶与海洋工程等学科。以本科教育为主，同时承担研究生培养任务，努力把学校建设成为优势突出、海洋特色鲜明的高水平应用型大学。
南宁师范大学将大力加强教师教育，把培养培训基础教育教师作为主要任务，重点建设教育学、地理学、马克思主义理论、化学、数学、社会学等学科专业，打造教师教育专业群，以本科教育为主，同时承担研究生培养任务，努力把学校建设成为区域特色鲜明的高水平师范大学。
自治区将根据国家层面的要求，加强领导、加大投入，引导两所学校根据全区经济社会发展需要，科学定位、内涵发展，加强教师队伍建设，不断提高教学科研工作水平，深化国际交流合作，办好人民满意的大学。