药店营养师证的考核主要由两个部分组成：理论知识考核和实操技能考核。

理论知识考核主要通过考试的形式来检验理论知识的学习程度，主要考察的内容包括药品的基础知识、营养学的基本原理、药品的配伍原则等，还会涉及到相关的法律法规等内容。

实操技能考核则是考察在实际工作中，应用所学理论知识解决实际问题的能力，具体考核内容可能包括处方配伍、食品加工操作、客户咨询等内容，考核方式通常是现场模拟或者一对一的指导。

药店营养师证的考核是对理论知识和实践能力的双重检验，旨在全面评价营养师的专业素质和临床能力。