营养师证的个人所得税的计算方法是按照《企业所得税法》的规定进行的，以下是一个大致的公式：

1、利润所得：=[(不含税收入-税前扣除项) * 适用税率] - (成本费用 - 基准工资)

2、营业执照年费：=（增值税-增值税欠款） * 税率

3、加计利息所得：=((利息收入-利息扣除项) * 适用税率]

4、预扣项目：=全部预扣项目与应纳税所得额之差。

在实际操作中，还需要考虑各种因素，如个体工商户、有限责任公司、股份有限公司等企业的具体情况，在选择申报方式时，建议咨询专业的税务顾问或查阅相关法律文件，以确保自己的权益得到保护，保持良好的财务记录和准确的核算也是防止误报的重要环节。