营养师证抵扣个税的申报流程可能因地区而异，但一般包括以下几个步骤：

1、填写《个人所得税综合所得汇算清缴表》：你需要将你的营养师证书和所有相关的收入、费用和支出填写到这个表格中。

2、缴纳个人所得税：按照税务机关的规定，你必须在每半年（如3个月）或者每年（如12个月）缴纳个人所得税，具体计算方式可能会根据你的所在地不同而有所不同，所以建议你咨询当地的税务机构。

3、核对扣款信息：在完成以上步骤后，你需要核对你的工资单和其他相关收入，以确保所有的扣除都是准确的，如果有任何遗漏，你需要向税务机关提出纠正申请。

4、报税：如果你的收入超过了一定的限额，你可以向税务机关提出税务报告，并进行纳税调整，税务机关会为你提供详细的财务分析，帮助你确定税务正确的调整金额。

5、税务补交：税务机关通常会在收到你的税务报告后，要求你进行相应的税收补交，如果你的收入减少了，你可能需要增加税额来弥补损失。

请注意，以上程序可能会因当地政策和法规的不同而有所差异，因此在申报前，最好先咨询你的所在地的税务机构或查阅最新的政策规定。